Au deuxième semestre 2008, suite à une rencontre avec l'Ambassadeur Ahmedou Ould-Abdallah, Représentant spécial du Secrétaire général des Nations Unies pour la Somalie, le HD Centre a été prié par ce dernier de participer au processus de médiation résultant de l'Accord de Djibouti, afin de fournir un soutien dans le traitement des questions de coopération politique. En partenariat étroit avec le Bureau politique des Nations Unies en Somalie (UNPOS) et le secrétariat du Représentant spécial, le HD Centre s'est dans un premier temps engagé en tant qu'observateur lors des négociations d'octobre.